Wetland Ecobiology

fa جداسازی و تشخیص دو گونه استافیلوکوس از آب‌های شور استان گلستان Comparison of biochemical and Molecular Methods in Isolation and identification of Halophilic bacteria from saline Lake Inche boroun, Almagol and Ajigol in Golestan Province تخصصي Special پژوهشي Research دریاچه‌های شور با محدوده شوری نزدیک به آب دریا، محیط‌های پرشور بوده اما اغلب دارای طیف وسیعی از عوامل میکروبی می‌باشند. هدف از این مطالعه جداسازی باکتری‌های هالوفیل و بینهایت هالوفیل از آب‌های شور اینچهبرون، آلماگل، آجی گل با دو روش بیوشیمیایی و مولکولی و همچنین مقایسه کارایی این دو روش می‌باشد. سال ۱۳۹۴، از ۳ دریاچه اینچه برون، آلماگل و آجی گل، تعداد ۵۱ نمونه (هرکدام ۱۷ نمونه) از مناطق مختلف با EC و pH متفاوت جمع‌آوری شد. این ایزوله‌ها بر روی محیط کشت انتخابی Saline nutrient broth کشت داده شدند. ایزوله‌ها براساس مورفولوژی کلنی و سلول بررسی شدند. مورفولوژی کلنی‌ها با تأکید بر تولید پیگمان، اندازه کلنی و کدورت تعیین شدند. این خصوصیات از طریق رشد کشت‌ها در EC، pH و غلظت نمک اپتیمم انجام شد. تستهای بیوشیمیایی کاتالاز، ژلاتیناز، آمیلاز، اکسیداز، سیترات، اوره آز، ایندول، وژسپروسکوئر، تخمیر/اکسیداسیون (لاکتوز، سوکرز، دکستروز) و روش مولکولی (PCR ژن کروموزومی tuf) انجام شد. براساس تست‌های بیوشیمیایی و روش مولکولی تعداد ۲۰ ایزوله هالوفیل و بی‌نهایت هالوفیل از آب‌های شور اینچه برون، آلماگل، آجی گل جداسازی شد که فراوان‌ترین گونه استافیلوکوکوس اپیدرمایدیس با ۹ مورد، پس‌ازآن استافیلوکوکوس کپیتیس مشاهده شد. با مقایسه روش بیوشیمیایی و مولکولی مشاهده شد که تست‌های بیوشیمیایی در ۹ مورد قادر به تشخیص گونه نبودند و بر این اساس، روش مولکولی به نسبت روش بیوشیمیایی از کارایی بالاتری برخوردار می‌باشد. محیط‌های پرشور به علت سختی شرایط زندگی، از تنوع زیستی کمتری نسبت به محیط‌های معتدل برخوردارند؛ اما ازنظر حضور میکروارگانیسم‌های نمک دوست و تحمل‌کننده نمک، تنوع بالایی دارند و انواعی از نمک دوست‌های نسبی و تحمل‌کننده‌های نمک در این محیط‌ها وجود دارند. Saline lakes with a salinity level close to that of seawater are extreme environments with a broad spectrum of microbial agents. The present study aimed at Comparison of biochemical and Molecular Methods in Isolation and identification of Halophilic bacteria from saline Lake Inche boroun, Almagol and Ajigol in Golestan Province. 51 samples were obtained from different regions of the above-mentioned lakes (seventeen samples from each lake) with varying EC and pH within a 4 month period from February to May 2015. The isolates were cultured on Saline nutrient broth and selected for a better identification. They were determined in terms of colony and cell morphology. Colony morphologies were specified with emphasis on pigment production, colony size, and turbidity. The properties were evaluated by culture growth in optimum EC, pH, and salinity. Biochemical tests of catalase, gelatinase, amylase, oxidase, citrate, urease, indole, Voges-Proskauer, fermentation/oxidation (lactose, sucrose, dextrose) and also PCR (tuf gene) were performed and the capability of producing the above-mentioned four enzymes was determined. According to the biochemical tests and molecular method, 22 halophile and extreme halophile isolates were separated from saline waters of Inchehboroun, Almagol, and Ajigol lakes where Staphylococcus epidermidis and Staphylococcus capitis were the most abundant species, respectively. Furthermore, three strains were able to produce the four enzymes; two strains belong to Staphylococcus capitis and one belongs to Staphylococcus hominis. Due to harsh living condition, saline environments have limited biological diversity compared to the so-called temperate environments. However, saline environments possess a high level of biological diversity in terms of halophile and halotolerant microorganisms with variety of relative halophiles and halotolerants living in these environments. اینچه برون, آجی گل, آلماگل, tuf, استافیلوکوکوس اپیدرمایدیس, استافیلوکوکوس کپیتیس. Inchehboroun, Almagol, and Ajigol lakes, tuf gene, Staphylococcus epidermidis, Staphylococcus capitis, Staphylococcus hominis. 27 38 http://jweb.ahvaz.iau.ir/browse.php?a_code=A-10-429-2&slc_lang=fa&sid=1 الهام خواستار 10031947532846003845 10031947532846003845 No آیلر جمالی 10031947532846003846 10031947532846003846 No فرهاد نیک نژاد 10031947532846003847 10031947532846003847 Yes