هم‌افزایی و توان‌افزایی فرماندهی در دریا از اهمیت ویژه‌ای برخوردار است. دستیابی به این مهم، مستلزم ایجاد و درک الگوی فرماندهی مبتنی بر علوم اعصاب در دریا است که بتواند ارتباط بین ابعاد و مؤلفه‌های آن را به‌وضوح تبیین کند. این پژوهش از نظر هدف، کاربردی و از نظر روش گردآوری داده‌ها، پیمایشی با رویکرد مدل‌سازی معادلات ساختاری است. در گام نخست، با استفاده از روش دلفی، نظرات ۱۷ نفر از صاحب‌نظران در خصوص مدل جمع‌آوری شد. سپس، برای تأیید الگو، پرسشنامه‌ای بین ۶۶ نفر از فرماندهان دریایی با جایگاه ۱۸ و بالاتر توزیع گردید. داده‌های جمع‌آوری‌شده با استفاده از نرم‌افزار SMART PLS و از طریق آزمون‌های توصیفی و روش مدل‌سازی معادلات ساختاری مورد تجزیه‌وتحلیل قرار گرفتند. بر اساس یافته‌های تحقیق، الگوی فرماندهی بر اساس علوم اعصاب در دریا که با استفاده از مدل‌سازی معادلات ساختاری توسعه یافته است، شامل شناسایی ۴ بعد اصلی(انضباط، تعامل، اعتمادبه­نفس، اقتدار)  در قالب ۱۳ مؤلفه پایبندی به اصول دریا، رعایت قوانین و مقررات، اطاعت از دستورات، وفاداری و تعهد، ارتباط و بهبود ارتباط، سازگاری با تغییرات و هماهنگی و همکاری، اعتماد به خود و دیگران، اعتماد به محیط کار و مهارت شخصی، تصمیم­گیری و توانایی رهبری، چارچوب جامعی برای فرماندهی دریایی ارائه می­دهد. تأکید بر مؤلفه­های کلیدی مانند توانایی رهبری (با ضریب مسیر 897/0) و رعایت قوانین (867/0) که با محیط­های نظامی سازگاری دارد.